MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ammonifex degensii KC4 plasmid pADEG01

Total Repeats: 499

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013386	CTG	3	9	98	106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893986
2	NC_013386	CTG	2	6	143	148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893986
3	NC_013386	GAA	2	6	209	214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893986
4	NC_013386	ACC	2	6	267	272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893986
5	NC_013386	ACC	2	6	300	305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893986
6	NC_013386	TGA	2	6	316	321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893986
7	NC_013386	CGT	2	6	340	345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893986
8	NC_013386	TGT	2	6	355	360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260893986
9	NC_013386	GGC	3	9	428	436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893986
10	NC_013386	TCA	3	9	579	587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260893986
11	NC_013386	TGC	3	9	730	738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893986
12	NC_013386	GAT	3	9	749	757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893986
13	NC_013386	GGA	2	6	864	869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893986
14	NC_013386	CTT	2	6	938	943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893986
15	NC_013386	ACCGT	2	10	954	963	20 %	20 %	20 %	40 %	260893986
16	NC_013386	GAT	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893986
17	NC_013386	GCG	2	6	1036	1041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893986
18	NC_013386	GAA	2	6	1044	1049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893986
19	NC_013386	GCGGTC	2	12	1050	1061	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260893986
20	NC_013386	CAC	2	6	1085	1090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893986
21	NC_013386	GCC	2	6	1112	1117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893986
22	NC_013386	GCC	2	6	1149	1154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893986
23	NC_013386	TGC	2	6	1210	1215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893986
24	NC_013386	CAGGGT	2	12	1343	1354	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260893986
25	NC_013386	ATG	2	6	1437	1442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893986
26	NC_013386	GTG	2	6	1518	1523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260893986
27	NC_013386	GAC	2	6	1532	1537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893986
28	NC_013386	CATCGA	2	12	1570	1581	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	260893986
29	NC_013386	GGACG	2	10	1616	1625	20 %	0 %	60 %	20 %	260893986
30	NC_013386	TTG	2	6	1674	1679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260893986
31	NC_013386	CCG	2	6	1717	1722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893986
32	NC_013386	CGGG	2	8	1744	1751	0 %	0 %	75 %	25 %	260893986
33	NC_013386	GCC	2	6	1775	1780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893986
34	NC_013386	TCC	2	6	1806	1811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893986
35	NC_013386	TGA	2	6	1819	1824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893986
36	NC_013386	CGC	2	6	1837	1842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893986
37	NC_013386	GCCCAC	2	12	1886	1897	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	260893986
38	NC_013386	CG	3	6	1899	1904	0 %	0 %	50 %	50 %	260893986
39	NC_013386	CAG	2	6	2038	2043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893986
40	NC_013386	GCCA	2	8	2129	2136	25 %	0 %	25 %	50 %	260893986
41	NC_013386	AGC	2	6	2177	2182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893986
42	NC_013386	GCT	2	6	2189	2194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893986
43	NC_013386	ACT	2	6	2387	2392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260893986
44	NC_013386	TGACAG	2	12	2425	2436	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260893986
45	NC_013386	TTG	3	9	2490	2498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260893986
46	NC_013386	CGA	2	6	2542	2547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893986
47	NC_013386	CGTGAC	2	12	2630	2641	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260893986
48	NC_013386	CGG	2	6	2695	2700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893986
49	NC_013386	TGG	3	9	2704	2712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260893986
50	NC_013386	GTA	3	9	2757	2765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893986
51	NC_013386	CCG	2	6	2787	2792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893986
52	NC_013386	GGGC	2	8	3088	3095	0 %	0 %	75 %	25 %	260893986
53	NC_013386	AGC	2	6	3125	3130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893986
54	NC_013386	AGT	2	6	3145	3150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893986
55	NC_013386	TACC	2	8	3247	3254	25 %	25 %	0 %	50 %	260893986
56	NC_013386	TGA	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893986
57	NC_013386	TCT	2	6	3325	3330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893986
58	NC_013386	GCC	2	6	3357	3362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893986
59	NC_013386	GCC	2	6	3393	3398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893986
60	NC_013386	CAG	2	6	3413	3418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893986
61	NC_013386	GC	3	6	3437	3442	0 %	0 %	50 %	50 %	260893986
62	NC_013386	CTC	2	6	3705	3710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893987
63	NC_013386	GCAG	2	8	3745	3752	25 %	0 %	50 %	25 %	260893987
64	NC_013386	CTG	2	6	3871	3876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893987
65	NC_013386	TCC	2	6	3881	3886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893987
66	NC_013386	CAG	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893987
67	NC_013386	ACC	2	6	3970	3975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893987
68	NC_013386	CGG	2	6	3978	3983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893987
69	NC_013386	CGG	2	6	3993	3998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893987
70	NC_013386	GAAC	2	8	4016	4023	50 %	0 %	25 %	25 %	260893987
71	NC_013386	TCC	2	6	4024	4029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893987
72	NC_013386	GGT	2	6	4083	4088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260893987
73	NC_013386	TTC	2	6	4102	4107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893987
74	NC_013386	CTT	2	6	4140	4145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893987
75	NC_013386	TCC	2	6	4160	4165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893987
76	NC_013386	TCA	2	6	4321	4326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260893987
77	NC_013386	CTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893987
78	NC_013386	CT	3	6	4360	4365	0 %	50 %	0 %	50 %	260893987
79	NC_013386	GAG	2	6	4428	4433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893987
80	NC_013386	CGG	2	6	4455	4460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893987
81	NC_013386	GTC	2	6	4488	4493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893987
82	NC_013386	CT	3	6	4525	4530	0 %	50 %	0 %	50 %	260893987
83	NC_013386	GCG	2	6	4552	4557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893987
84	NC_013386	GAG	3	9	4573	4581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893987
85	NC_013386	GA	3	6	4596	4601	50 %	0 %	50 %	0 %	260893987
86	NC_013386	CTC	2	6	4626	4631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893987
87	NC_013386	AGG	2	6	4699	4704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893987
88	NC_013386	TG	3	6	4798	4803	0 %	50 %	50 %	0 %	260893987
89	NC_013386	CTT	2	6	4910	4915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893987
90	NC_013386	CCA	2	6	4964	4969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893987
91	NC_013386	GCCT	2	8	5029	5036	0 %	25 %	25 %	50 %	260893987
92	NC_013386	GTC	2	6	5070	5075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893987
93	NC_013386	CG	3	6	5087	5092	0 %	0 %	50 %	50 %	260893987
94	NC_013386	TCC	2	6	5102	5107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893987
95	NC_013386	CGG	2	6	5147	5152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893987
96	NC_013386	TTG	2	6	5158	5163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260893987
97	NC_013386	GCC	2	6	5182	5187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893987
98	NC_013386	CAT	2	6	5276	5281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260893987
99	NC_013386	CAC	4	12	5307	5318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893987
100	NC_013386	GCC	2	6	5392	5397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893987
101	NC_013386	CCGC	2	8	5435	5442	0 %	0 %	25 %	75 %	260893987
102	NC_013386	AG	3	6	5452	5457	50 %	0 %	50 %	0 %	260893987
103	NC_013386	GAT	2	6	5499	5504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893987
104	NC_013386	TCA	2	6	5560	5565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260893987
105	NC_013386	ACCC	2	8	5595	5602	25 %	0 %	0 %	75 %	260893987
106	NC_013386	TGC	2	6	5688	5693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893987
107	NC_013386	GAC	2	6	5805	5810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893987
108	NC_013386	GCC	2	6	5878	5883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893987
109	NC_013386	GCC	2	6	5914	5919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893987
110	NC_013386	CAG	2	6	5934	5939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893987
111	NC_013386	GC	3	6	5958	5963	0 %	0 %	50 %	50 %	260893987
112	NC_013386	TAA	2	6	6230	6235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260893988
113	NC_013386	CGC	2	6	6239	6244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893988
114	NC_013386	TCGA	2	8	6268	6275	25 %	25 %	25 %	25 %	260893988
115	NC_013386	GA	3	6	6274	6279	50 %	0 %	50 %	0 %	260893988
116	NC_013386	CCG	2	6	6332	6337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893988
117	NC_013386	ACC	2	6	6367	6372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893988
118	NC_013386	GCT	2	6	6398	6403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893988
119	NC_013386	CTG	2	6	6513	6518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893988
120	NC_013386	C	6	6	6519	6524	0 %	0 %	0 %	100 %	260893988
121	NC_013386	G	6	6	6573	6578	0 %	0 %	100 %	0 %	260893988
122	NC_013386	ACC	3	9	6622	6630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893988
123	NC_013386	CCCG	2	8	6698	6705	0 %	0 %	25 %	75 %	260893988
124	NC_013386	GGA	2	6	6721	6726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893988
125	NC_013386	ACC	2	6	6751	6756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893988
126	NC_013386	CCG	2	6	6779	6784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893988
127	NC_013386	AAGCA	2	10	6804	6813	60 %	0 %	20 %	20 %	260893988
128	NC_013386	GCA	2	6	6851	6856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893988
129	NC_013386	CCGG	2	8	6939	6946	0 %	0 %	50 %	50 %	260893989
130	NC_013386	CCA	2	6	6947	6952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893989
131	NC_013386	CTT	2	6	6981	6986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893989
132	NC_013386	CTC	2	6	7011	7016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893989
133	NC_013386	GCT	2	6	7055	7060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893989
134	NC_013386	GCT	2	6	7074	7079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893989
135	NC_013386	AGGA	2	8	7148	7155	50 %	0 %	50 %	0 %	260893989
136	NC_013386	CCG	2	6	7177	7182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893989
137	NC_013386	GC	3	6	7208	7213	0 %	0 %	50 %	50 %	260893989
138	NC_013386	CGCAGG	2	12	7410	7421	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260893989
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141	NC_013386	CGG	2	6	7569	7574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893989
142	NC_013386	GGA	2	6	7588	7593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893989
143	NC_013386	GA	3	6	7592	7597	50 %	0 %	50 %	0 %	260893989
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147	NC_013386	CCT	2	6	7694	7699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893989
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151	NC_013386	GCT	2	6	8111	8116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893990
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164	NC_013386	GGGA	2	8	8685	8692	25 %	0 %	75 %	0 %	260893991
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248	NC_013386	GCTTT	2	10	12921	12930	0 %	60 %	20 %	20 %	260893995
249	NC_013386	GAG	2	6	13077	13082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893995
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255	NC_013386	TCCC	2	8	13568	13575	0 %	25 %	0 %	75 %	260893996
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259	NC_013386	CCA	2	6	13682	13687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893996
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262	NC_013386	CTT	2	6	13815	13820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893996
263	NC_013386	CAC	2	6	13884	13889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893996
264	NC_013386	CCT	2	6	13913	13918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893996
265	NC_013386	GCAG	2	8	13973	13980	25 %	0 %	50 %	25 %	260893996
266	NC_013386	CCG	2	6	14025	14030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893996
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269	NC_013386	CTT	2	6	14106	14111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893996
270	NC_013386	CCGC	2	8	14135	14142	0 %	0 %	25 %	75 %	260893996
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278	NC_013386	TCAC	2	8	15595	15602	25 %	25 %	0 %	50 %	260893998
279	NC_013386	CTG	2	6	15606	15611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893998
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282	NC_013386	CCT	2	6	15743	15748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893998
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286	NC_013386	CTC	2	6	15952	15957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893998
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289	NC_013386	CTT	2	6	16095	16100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893998
290	NC_013386	GGC	2	6	16158	16163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893998
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297	NC_013386	CCT	2	6	16449	16454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893998
298	NC_013386	GAC	2	6	16503	16508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893998
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375	NC_013386	CCT	2	6	19965	19970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260894004
376	NC_013386	CTTCC	2	10	20018	20027	0 %	40 %	0 %	60 %	260894004
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380	NC_013386	GGC	2	6	20245	20250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260894004
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382	NC_013386	AAC	2	6	20273	20278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260894004
383	NC_013386	GTC	2	6	20288	20293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260894004
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388	NC_013386	TCCG	2	8	20498	20505	0 %	25 %	25 %	50 %	260894004
389	NC_013386	TCG	2	6	20532	20537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260894004
390	NC_013386	TTC	2	6	21468	21473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260894005
391	NC_013386	CT	3	6	21485	21490	0 %	50 %	0 %	50 %	260894005
392	NC_013386	CCGC	2	8	21517	21524	0 %	0 %	25 %	75 %	260894005
393	NC_013386	CCTG	2	8	21607	21614	0 %	25 %	25 %	50 %	260894005
394	NC_013386	CTC	2	6	21615	21620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260894005
395	NC_013386	CCCAA	2	10	21646	21655	40 %	0 %	0 %	60 %	260894005
396	NC_013386	CATC	2	8	21748	21755	25 %	25 %	0 %	50 %	260894005
397	NC_013386	CT	4	8	21818	21825	0 %	50 %	0 %	50 %	260894005
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401	NC_013386	A	6	6	21920	21925	100 %	0 %	0 %	0 %	260894005
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